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Text File  |  1995-03-04  |  2.0 KB  |  45 lines
  1. **********************************
  2. * Somatomedin B domain signature *
  3. **********************************
  4.  
  5. Somatomedin B, a serum  factor of  unknown  function, is  a  cysteine-rich  45
  6. residues  peptide  which  is  proteolytically   derived  from  the  N-terminal
  7. extremity  of the cell-substrate adhesion protein vitronectin [1]. Somatomedin
  8. B-like domains are also found [2] in the following proteins:
  9.  
  10.  - Plasma-cell membrane glycoprotein PC-1.  PC-1, a  protein  with  nucleotide
  11.    pyrophosphatase (EC 3.6.1.9)  and alkaline phosphodiesterase I (EC 3.1.4.1)
  12.    activities [3], is a  type-II  membrane protein of about 870 residues.  PC1
  13.    consists of a short cytoplasmic  domain, followed by a transmembrane region
  14.    and a large extracellular domain.  Two  tandem  copies  of a  somatomedin B
  15.    domain are present in the N-terminal extremity of the extracellular domain.
  16.  - Placental protein 11 (PP11).  PP11  is  a  placental protein  that seems to
  17.    possess an amidolytic activity.  A  copy  of  the  somatomedin B  domain is
  18.    present at the N-terminal extremity.
  19.  
  20. As shown in  the  following  schematic  representation  below  there are eight
  21. conserved cysteines  in  the  somatomedin B  domain  and they are probably all
  22. involved in disulfide bonds.
  23.  
  24.          xxCxxxxxxCxxxxxxxxxCxCxxxCxxxxxCCxxxxxCxxxxx
  25.                             ********************
  26.  
  27. 'C': conserved cysteine probably involved in a disulfide bond.
  28. '*': position of the pattern.
  29.  
  30. -Consensus pattern: C-x-C-x(3)-C-x(5)-C-C-x-[DN]-[FY]-x(3)-C
  31. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  32. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  33.  
  34. -Expert(s) to contact by email: Jenne D.
  35.                                 djenne@clsuni51.bitnet
  36.  
  37. -Last update: December 1991 / First entry.
  38.  
  39. [ 1] Jenne D., Stanley K.K.
  40.      Biochemistry 26:6735-6742(1987).
  41. [ 2] Jenne D.
  42.      Biochem. Biophys. Res. Commun. 176:1000-1006(1991).
  43. [ 3] Rebbe N.F., Tong B.D., Finley E.M., Hickman S.
  44.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88:5192-5196(1991).
  45.